公元2009年，此时的科技已做到逆转时光，医学方面也能做思想移植。财团老板肯勒斯年迈病故，他令手下华森德保存他的思想，然后把时光逆转到1991年，当时正在进行大赛车。赛车新秀费龙夺魁在望，却不幸撞上陆桥，连人带车炸得粉碎…

　　一如往常，护理师露西奔走于各个小儿科病房，BP机、哭喊声填满了她的崩溃日常。但今晚，有个小孩让她格外心力交瘁：四岁的亚当因营养不良入院观察，他妈妈海蓓卡执意要彻夜守在孩子身旁，偏偏她被法院裁定照顾失当，不得长时间探访。…

　　　　宇宙公主的妹妹月亮公主戏份增加。新地图“水晶帝国”重现，反派黑晶王试图夺权。主角团协助韵律公主守护帝国，暮光最终完成任务并进化成“天角兽”，成为友谊公主。

　　　　故事叙述一只叫暮光闪闪(TwilightSparkle)的小马为了执行导师塞拉斯提娅公主（PrincessCelestia）给她的任务，与助手斯穗龙（Spike）一起来到小马镇学习有关友谊的魔法的知识，其中她认识了苹果杰克（Applejack）、瑞瑞…

　　　　King Sombra曾经统治小马国边缘的水晶王国，带来了无尽的苦难。后来他被塞拉斯迪亚公主和露娜公主联合击败，变成阴影，并被放逐。　　一千年后，King Sombra卷土重来，想要重新统治水晶王国。大公主希望暮光闪闪一行去保护水晶王…

　　　　水晶城堡中的“友谊地图”开始指派任务，推动配角（如星光熠熠、崔克西）发展。本季引入关键反派“星光熠熠”，她通过时间魔法抹除主角们的可爱标志，最终被暮光感化加入友谊阵营。

　　　　小马国与其他种族（幻形灵、狮鹫、牦牛等）的冲突成为主线。虫茧女王试图通过寄生控制小马国，最终被进化后的幻形灵王子“邪茧”击败。星光熠熠的救赎之路继续展开。

　　　　故事叙述一只叫暮光闪闪(TwilightSparkle meiju5.net)的小马为了执行导师塞拉斯提娅公主（PrincessCelestia）给她的任务，与助手斯穗龙（Spike）一起来到小马镇学习有关友谊的魔法的知识，其中她认识了苹果杰克（Appleja…